Gmina należy do jednostek wyróżniających się szczególną dbałością o ochronę środowiska naturalnego i działań proekologicznych. W 2001 roku Lokalna Wspólnota zakwalifikowała się do ścisłej krajowej czołówki w konkursie na najlepiej rozwiązaną gospodarkę wodno – ściekową na terenach wiejskich.

Wszystkie wioski posiadają sieć wodociągową, a woda dla celów socjalno – bytowych i gospodarczych uzdatniana jest w dwóch stacjach wodociągowych. Ponadto opracowany w 2000 roku Program Gospodarki Ściekowej zakłada docelowy rozwój sieci kanalizacyjnej obejmującej gminę.

Znaczna i przebiegająca w sposób sukcesywny poprawa nastąpiła również w zakresie przebudowy kotłowni węglowych na gazowo – olejowe.

Na terenie gminy znajdują się dwa rezerwaty przyrody „Rejna” i „Balczewo”.

Rezerwat w Rejnie zaliczany jest do rezerwatów leśno – stepowych. Utworzony został w 1962 roku, obejmuje obszar o pow. 5,8 ha boru sosnowego, na terenie którego występuje wiśnia karłowata, zwana popularnie wisienką stepową. Trzy bogate skupienia tego rzadkiego w innych regionach krzewu można odnaleźć na północnym brzegu lasu. Na wzniesieniu pod osłoną starych sosen można spotkać starsze, pokryte porostami okazy sięgające do 1,5 metra, natomiast w sosnowych zagajnikach występują młode przyziemne rośliny. Wisienka karłowata kwitnie i owocuje. Krzew ten posiada u nasady klinowate, a na brzegu lekko karbowane listki, jednak najłatwiej rozpoznać go po czerwonych, kwaskowych owocach. W podszyciu obok sosny i samej wiśni karłowatej występuje jarzębina, leszczyna, szakłak pospolity, róża polna, trzmielina brodawkowata, kalina, porost brzozy i gradu. W runie dominuje trzcinnik leśny, borówki, w mniejszym stopniu występują również gatunki kserotermiczne, jak bociszek  czerwony czy pajęcznica gałęziasta.

Rezerwat „Balczewo” to rezerwat o powierzchni 24,40 ha utworzony został w 1963 roku w celu zachowania ze względów naukowych i dydaktycznych miejsc lęgowych i żerowisk ptaków błotnych i wodnych. Rezerwat jest położony w południowo – wschodniej części kompleksu leśnego Rejna – Balczewo, usytuowanego na Nizinie Kujawskiej między Dąbrową Biskupią a Inowrocławiem. Na ogólna powierzchnię rezerwatu składa się powierzchnia leśna – 1,00 ha (w całości powierzchnia leśna zalesiona) oraz powierzchnia nieleśna, tzw. nieużytki 23,40 ha (w całości bagna). Ponadto rezerwat zabezpieczony jest otuliną obejmującą przyległe drzewostany. Na obszarze rezerwatu „Balczewo”, ze względu na bagienny typ gospodarki wodnej , przeważają gleby torfowe, torfowisk niskich, zajmujące całą powierzchnię bagna oraz gleby murszowo-glejowe, występujące płatami i smugami na północnym i wschodnim obrzeżu rezerwatu, które wytworzyły się w piaskach rzecznych.

Zbiorowisko leśne rezerwatu zaliczono do zespołu śródlądowego boru wilgotnego. Drzewostan tworzy tu sosna z dużym udziałem brzozy brodawkowatej. W podszyciu miejscami występuje wierzba szara, kruszyna i jarzębina. Runo zdominowane jest przez łan trzęślicy modrej. Natomiast obszar bagienny rezerwatu „Balczewo” przypisano do zespołu szuwaru trzcinowego i zespołu łozowiska wierzby szarej. Szuwar trzcinowy zajmuje większą powierzchnię bagna będącego miejscem lęgowym ptactwa wodnego i błotnego. Zespół ten tworzy zwarty łan wysokiej trzciny. W dolnej warstwie tego zbiorowiska znajdziemy gatunki charakterystyczne dla mokrych łąk i olsów. Z kolei łozowisko wierzby szarej występuje szeroką smugą na południowym obrzeżu rezerwatu. Tworzą go tu zwarte zarośla wierzby szarej i wierzby pięciopręcikowej z domieszką wierzby uszatej. W runie dominują gatunki charakterystyczne dla olsów oraz gatunki szuwarowe. Interesującym jednak zjawiskiem, co prawda nie w rezerwacie, ale jego otulinie jest licznie występujące stanowisko chronionego cisa.

Nieodłącznym elementem krajobrazu gminy Dąbrowa Biskupia są – znajdujące się w każdej wsi – bocianie gniazda. Mieszkańcy przy pomocy Gminy oraz Urzędu Wojewódzkiego wykonują prace naprawcze istniejących siedlisk, a ponadto przygotowują nowe miejsca umożliwiające zakładanie gniazd.